Гугенотские войны были кровавыми и довольно продолжительными. Как только наступало перемирие, и казалось, что вражда позади, разгоралась новая меж усобица. И так на протяжении нескольких лет. Католики и гугеноты или протестанты то заключали мир, то нападали друг на друга. Все более менее наладилось после заключения Сен-Жерменский мира, а до тех пор были трудные времена.

Гугеноты подвергались постоянному гонению, еще Франциск I приказал уничтожить все протестантские сочинения. Но даже угрозы смертной казни не мешали верующим продолжать свои реформы. Генрих II издал эдикт, по которому все гугеноты должны были сожжены на кострах. Он направил все свои силы на искоренение ереси во Франции. В те времена уже существовало около 5000 католических общин. Была создана специальная комиссия, следившая за уничтожением ереси – «огненная палата». Возник заговор против Гизов, которые оказывали сильное влияние на короля. Однако заговор был раскрыт, и многие заговорщики погибли или были позднее казнены.

С приходом Карла IX к власти, была отменена смертная казнь за ересь. Король хотел прекратить вражду. Поэтому был проведен религиозный диспут в Пуасси. Но он не привел к желаемым результатом, соглашение так и не было достигнуто. Стремление подавить реформации помешало прийти к консенсусу. Позднее, после того как гугеноты получили право на свободу богослужения, Франсуа де Гиз напал на толпу гугенотов, которые собрались вместе помолиться. Это положило начало междоусобной войне. Всего их было восемь.

Первая война закончилась соглашением, по которому гугеноты вновь могли исповедовать свою веру. Однако, королева-мать отменила все вольности гугенотов. Она лишила Гизов влияния. Гугеноты решили захватить короля и заставить выполнить их требования. Но заговор был раскрыт. В результате был заключен очередной не долгосрочный мир. Через полгода разгорелась новая война.

В конечном итоге, после многократных войн и примирений был заключен Сен-Жерменский мир. Гугенотом были отданы крепости, амнистии и свобода вероисповедания.